Berdasarkan wilayah administrasi bahwa luas Desa Wilayut adalah 530,8 Ha. yang terletak pada 7o38’38.85” S 112o67’75.67” T dan pada ketinggian 7 meter dari permukaan air laut. Adapun batas-batas wilayah desa Panjunant:
| Batas Desa | ||
| Utara | : |
Berbatasan dengan Desa Sadang |
| Selatan | : |
Berbatasan dengan Desa Sukodono |
| Timur | : |
Berbatasan dengan Desa Masangan Kulon |
| Barat | : |
Berbatasan dengan Desa Bangsri |
Iklim Desa Panjunan, sebagaimana desa-desa lain di wilayah Indonesia mempunyai iklim kemarau dan penghujan, hal tersebut mempunyai pengaruh langsung terhadap pola tanam yang ada di Desa Panjunan Kecamatan Sukodono.